 | Programme d’études 2017-2018 | English | |
 | Traitement des données biologiques | ||
Unité d’enseignement du programme de Master en biologie des organismes et écologie, à finalité approfondie à la Faculté des Sciences |
| Code | Type | Responsable | Coordonnées du service | Enseignant(s) |
|---|---|---|---|---|
| US-M2-BIOEFA-015-M | UE optionnelle | GROSJEAN Philippe | S807 - Ecologie numérique des milieux aquatiques |
| Langue d’enseignement | Langue d’évaluation | HT(*) | HTPE(*) | HTPS(*) | HR(*) | HD(*) | Crédits | Pondération | Période d’enseignement |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Français | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 2 | 2 | 1er quadrimestre |
| Code(s) d’AA | Activité(s) d’apprentissage (AA) | HT(*) | HTPE(*) | HTPS(*) | HR(*) | HD(*) | Période d’enseignement | Pondération |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| S-BIOG-077 | 100.00% |
| Unité d'enseignement |
|---|
Objectifs par rapport aux acquis d'apprentissage du programme
- Avoir acquis, dans le domaine des sciences biologiques, et particulièrement dans le domaine de la biologie des organismes et de l'écologie, des connaissances hautement spécialisées et intégrées ainsi que de larges compétences, prolongeant celles qui relèvent du niveau de bachelier en sciences biologiques
- Développer et intégrer un fort degré d'autonomie
- -Poursuivre sa formation et développer de nouvelles compétences de façon autonome
- Avoir acquis, dans le domaine des sciences biologiques, et particulièrement dans le domaine de la biologie des organismes et de l'écologie, des connaissances hautement spécialisées et intégrées ainsi que de larges compétences, prolongeant celles qui relèvent du niveau de bachelier en sciences biologiques
- Développer et intégrer un fort degré d'autonomie
- -Poursuivre sa formation et développer de nouvelles compétences de façon autonome
Acquis d'apprentissage UE
Perfectionner les étudiants biologistes dans le traitement des données biologiques en les initiant à des notions complémentaires aux biostatistiques. Ce cours complète les notions de biostatistique vues jusqu'ici par divers topics plus avancés qui ne sont normalement pas abordés dans le cadre de tels cours: problèmes liés à la précision de calcul des ordinateurs, meilleur encodage des données selon le problème posé, comment effectuer des analyses parfaitement reproductibles, générateur de nombres pseudo-aléatoires reproductibles, pré-tri des données à l'aide de commandes SQL. Ce cours est modulable partiellement en fonction de besoins spécifiques des étudiants.
Contenu de l'UE
Gestion des données; bases de données; requêtes SQL; language S (logiciel R); calcul en virgule flottante; génération de nombre pseudo-aléatoires; analyse reproductible; tests unités; format des données; optimisation du temps de calcul; optimisation de l'utilisation de la mémoire vive; algorithmes vectorisés.
Compétences préalables
Biostatistiques avancées.
Types d'évaluations Q1 pour l'UE
- Examen oral
Commentaire sur les évaluations Q1 de l'UE
Evaluation sur base de questions/réponses à l'examen oral.
Types d'évaluation Q3 pour l'UE
- Examen oral
Commentaire sur les évaluations Q3 de l'UE
Evaluation sur base de questions/réponses à l'examen oral.
Types d'évaluation rattrapage BAB1 (Q1) pour l'UE
- Examen oral
Commentaire sur les évaluations rattr. Q1 de l'UE
Evaluation sur base de questions/réponses à l'examen oral.
Types d'activités
| AA | |
|---|---|
| S-BIOG-077 |
Mode d'enseignement
| AA | |
|---|---|
| S-BIOG-077 |
Supports principaux
| AA | |
|---|---|
| S-BIOG-077 |
Supports principaux non reproductibles
| AA | |
|---|---|
| S-BIOG-077 |
Supports complémentaires
| AA | |
|---|---|
| S-BIOG-077 |
Supports complémentaires non reproductibles
| AA | |
|---|---|
| S-BIOG-077 |
Autres références conseillées
| AA | |
|---|---|
| S-BIOG-077 |
Reports des notes d'AA d'une année à l'autre
| AA | |
|---|---|
| S-BIOG-077 |