![]() | Programme d’études 2025-2026 | English | |
| Bioinformatique | |||
Activité d'apprentissage |
| Code | Titulaire(s) | Co-Titulaire(s) | Suppléant(s) et autre(s) | Établissement(s) |
|---|---|---|---|---|
| S-BIOG-143 |
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| Langue d’enseignement | Langue d’évaluation | HT(*) | HTPE(*) | HTPS(*) | HR(*) | HD(*) | Période d’enseignement |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Français | Français | 15 | 0 | 0 | 0 | 0 | Q1 |
Contenu de l'AA
Cours théoriques (50%)
- Introduction générale : Réalité mathématique VS réalité biologique
- Séquences biologiques, Bases de données...
- Alignements de séquences
- Comment "interroger" les banques de données publiques
- Méthodes de séquençages de nouvelle(s) génération(s) (NGS)
- Transcriptome & Génome
- Applications pratiques & Questionnements du biologiste
Sessions pratiques & exercices (50%)
- Recherche de séquences, notion d'homologie de séquences, annotations fonctionnelles (Outils en ligne: NCBI, Expasy, plateforme Galaxy,...)
- Analyse de l'expression différentielle à partir de données RNA-Seq & Visualisation des données d'expression (Outils en ligne: plateforme Galaxy, Degust, MetaboAnalyst)
- Visualisation de données génomiques à l'aide d'un Genome Browser (IGV, serveurs en ligne)
Supports principaux non reproductibles
Matériel de cours disponible sur Moodle.
Support complémentaires non reproductibles
Sans objet
Autres références conseillées
Sans objet
Mode d'enseignement
Types d'activités
Evaluations
Les modalités d'évaluation de l'AA sont précisées dans la fiche de l'UE dont elle dépend
Implantation(s) où l’activité d’apprentissage sera organisée
Implantation(s) où l’activité d’apprentissage sera évaluée