Objectifs par rapport aux acquis d'apprentissage du programme

• Compétence 2 : Avoir acquis les compétences professionnelles en relation avec la finalité définissant le diplôme
• -Etre spécialisé dans au moins un sous-domaine de la biochimie, biologie moléculaire et cellulaire
• -S'initier à la recherche scientifique et au monde de la recherche
• Avoir acquis, dans le domaine des sciences biologiques, et particulièrement dans le domaine de la biochimie, biologie moléculaire et cellulaire, des connaissances hautement spécialisées et intégrées ainsi que de larges compétences, prolongeant celles qui relèvent du niveau de bachelier en sciences biologiques
• Appliquer une méthodologie scientifique
• -Faire preuve de rigueur, d'autonomie, de créativité, d'honnêteté intellectuelle, de sens éthique et déontologique
• Gérer et mener un travail de recherche, de développement ou d'innovation
• -Etre capable d'appréhender une problématique inédite relevant des sciences biologiques en biochimie, biologie moléculaire et cellulaire et de ses applications
• -Rechercher de façon méthodique des informations scientifiquement valides, mener une analyse critique, proposer et argumenter des solutions éventuellement innovantes à des problématiques ciblées
• Maîtriser les techniques de communication
• -Pouvoir communiquer de façon claire, structurée et argumentée, tant à l'oral qu'à l'écrit, ses conclusions, ses propositions originales ainsi que les connaissances et principes sous-jacents
• -Etre capable d'adapter sa communication à des publics divers
• -Maîtriser les techniques de communications scientifiques écrites et orales tant en français qu'en anglais
• Développer et intégrer un fort degré d'autonomie
• -Etre capable d'acquérir seul de nouveaux savoirs
• -Poursuivre sa formation et développer de nouvelles compétences de façon autonome
• -Développer et intégrer un fort degré d'autonomie pour pouvoir évoluer dans de nouveaux contextes

Acquis d'apprentissage de l'UE

L'objectif de ce cours est de montrer aux étudiants l'intégration des données issues des méthodes d'analyse utilisées en génomique, transcriptomique, protéomique, et métabonomique.  A l'issue de ce cours, les étudiants seront capables de :

- comprendre l'importance d'intégrer les données de plusieurs sciences "omiques" dans l'étude d'un mécanisme biologique complexe
- intégrer et interpréter des données de type 'omique"
- décrire les concepts et méthodes utilisées lors de l'acquisition des données 'omiques'

Contenu de l'UE : descriptif et cohérence pédagogique

1. Partie Métabonomique (Prof. Jean-Marie Colet):

- étapes d'une étude métabonomique
- analyse de biofluides par Résonance Magnétique Nucléaire du proton
- analyse multivariée des spectres

2. Partie Protéomique : (Prof. Rudy Wattiez)

- rappel sur la spectrométrie de masse
- étapes d'une étude protéomique

3. Partie Génomique/Transcriptomique : (Dr Frédérique Coppée)
 
- séquençage à haut débit : NGS et RNA-seq, projet ENCODE et génome humain, epi-génome
- étapes d'une étude transcriptomique
- exemples de format/interfaces web d'analyses classiques de séquences incluant les représentations en ‘heatmap', réseaux ou voies de signalisation (étude de régulation des gènes, signatures biologiques)

Compétences préalables

Connaissances de base de la biologie cellulaire et de la biologie moléculaire
Connaissances de base dans les méthodes spectroscopiques
Connaissances de base en statistiques